MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 812

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015979	A	7	7	318	324	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
2	NC_015979	A	6	6	333	338	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
3	NC_015979	TCAA	2	8	356	363	50 %	25 %	0 %	25 %	347533701
4	NC_015979	ATA	2	6	377	382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
5	NC_015979	TAA	2	6	408	413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
6	NC_015979	ATC	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533701
7	NC_015979	GAA	2	6	454	459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533701
8	NC_015979	TAGA	2	8	617	624	50 %	25 %	25 %	0 %	347533701
9	NC_015979	AGC	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533701
10	NC_015979	GTA	2	6	764	769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
11	NC_015979	A	6	6	827	832	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
12	NC_015979	ATA	2	6	890	895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
13	NC_015979	T	8	8	899	906	0 %	100 %	0 %	0 %	347533701
14	NC_015979	T	6	6	936	941	0 %	100 %	0 %	0 %	347533701
15	NC_015979	AGTC	2	8	953	960	25 %	25 %	25 %	25 %	347533701
16	NC_015979	A	6	6	965	970	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
17	NC_015979	TAAT	2	8	1001	1008	50 %	50 %	0 %	0 %	347533701
18	NC_015979	AAAC	2	8	1030	1037	75 %	0 %	0 %	25 %	347533701
19	NC_015979	ATACT	2	10	1109	1118	40 %	40 %	0 %	20 %	347533701
20	NC_015979	A	6	6	1149	1154	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
21	NC_015979	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533701
22	NC_015979	TGA	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
23	NC_015979	TGA	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
24	NC_015979	ATG	2	6	1418	1423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
25	NC_015979	TAAT	2	8	1433	1440	50 %	50 %	0 %	0 %	347533701
26	NC_015979	TTA	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533701
27	NC_015979	TGA	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
28	NC_015979	TAA	2	6	1551	1556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
29	NC_015979	A	6	6	1566	1571	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
30	NC_015979	GGAAA	2	10	1574	1583	60 %	0 %	40 %	0 %	347533701
31	NC_015979	T	6	6	1680	1685	0 %	100 %	0 %	0 %	347533701
32	NC_015979	TGA	3	9	1746	1754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
33	NC_015979	TAGA	2	8	1757	1764	50 %	25 %	25 %	0 %	347533701
34	NC_015979	AAG	2	6	2377	2382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533702
35	NC_015979	A	6	6	2386	2391	100 %	0 %	0 %	0 %	347533702
36	NC_015979	TTG	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533702
37	NC_015979	AGCA	2	8	2443	2450	50 %	0 %	25 %	25 %	347533702
38	NC_015979	GTT	2	6	2480	2485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533702
39	NC_015979	AC	3	6	2495	2500	50 %	0 %	0 %	50 %	347533702
40	NC_015979	TGAG	2	8	2561	2568	25 %	25 %	50 %	0 %	347533703
41	NC_015979	CAT	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533703
42	NC_015979	CG	3	6	2626	2631	0 %	0 %	50 %	50 %	347533703
43	NC_015979	ATT	2	6	2640	2645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533703
44	NC_015979	ACTC	2	8	2647	2654	25 %	25 %	0 %	50 %	347533703
45	NC_015979	A	6	6	2684	2689	100 %	0 %	0 %	0 %	347533703
46	NC_015979	GAA	2	6	2737	2742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533703
47	NC_015979	AAC	2	6	2747	2752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533703
48	NC_015979	AAC	2	6	2793	2798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533703
49	NC_015979	AATTA	3	15	2822	2836	60 %	40 %	0 %	0 %	347533703
50	NC_015979	ATT	3	9	4032	4040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533704
51	NC_015979	CTT	2	6	4053	4058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533704
52	NC_015979	ATGA	2	8	4098	4105	50 %	25 %	25 %	0 %	347533704
53	NC_015979	ATA	2	6	4148	4153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533704
54	NC_015979	GCA	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533704
55	NC_015979	A	6	6	4165	4170	100 %	0 %	0 %	0 %	347533704
56	NC_015979	ATA	2	6	4182	4187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533704
57	NC_015979	AAAAT	2	10	4206	4215	80 %	20 %	0 %	0 %	347533704
58	NC_015979	ATA	3	9	4223	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533704
59	NC_015979	ATT	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533704
60	NC_015979	T	6	6	4299	4304	0 %	100 %	0 %	0 %	347533704
61	NC_015979	T	6	6	4315	4320	0 %	100 %	0 %	0 %	347533704
62	NC_015979	ATT	2	6	4351	4356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533705
63	NC_015979	CCT	2	6	4401	4406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347533705
64	NC_015979	TTC	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533705
65	NC_015979	CTT	2	6	4428	4433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533705
66	NC_015979	CT	3	6	4438	4443	0 %	50 %	0 %	50 %	347533705
67	NC_015979	TAA	2	6	4501	4506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533705
68	NC_015979	AAC	2	6	4519	4524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533705
69	NC_015979	ACT	2	6	4751	4756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533706
70	NC_015979	TGT	2	6	4757	4762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533706
71	NC_015979	CCA	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533706
72	NC_015979	ATG	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533706
73	NC_015979	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533706
74	NC_015979	TCA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533706
75	NC_015979	TGTT	2	8	5739	5746	0 %	75 %	25 %	0 %	347533707
76	NC_015979	AT	3	6	5768	5773	50 %	50 %	0 %	0 %	347533707
77	NC_015979	CTT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533707
78	NC_015979	GAT	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533707
79	NC_015979	A	7	7	5882	5888	100 %	0 %	0 %	0 %	347533707
80	NC_015979	TGTCAT	2	12	6003	6014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347533707
81	NC_015979	TGC	2	6	6023	6028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533707
82	NC_015979	ACG	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533707
83	NC_015979	T	6	6	6153	6158	0 %	100 %	0 %	0 %	347533707
84	NC_015979	ATA	2	6	6167	6172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533707
85	NC_015979	GAAAT	2	10	6257	6266	60 %	20 %	20 %	0 %	347533708
86	NC_015979	GCT	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533708
87	NC_015979	CAA	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533708
88	NC_015979	AACT	2	8	6441	6448	50 %	25 %	0 %	25 %	347533708
89	NC_015979	AGA	2	6	6493	6498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533708
90	NC_015979	A	6	6	6648	6653	100 %	0 %	0 %	0 %	347533708
91	NC_015979	CTAA	2	8	6662	6669	50 %	25 %	0 %	25 %	347533708
92	NC_015979	ATA	2	6	6690	6695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533708
93	NC_015979	CTT	2	6	6817	6822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533708
94	NC_015979	ACT	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533708
95	NC_015979	CTT	2	6	6913	6918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533708
96	NC_015979	CAA	2	6	7013	7018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533708
97	NC_015979	A	7	7	7024	7030	100 %	0 %	0 %	0 %	347533708
98	NC_015979	CAA	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533708
99	NC_015979	TAG	3	9	7167	7175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533708
100	NC_015979	GAG	2	6	7178	7183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533708
101	NC_015979	TGGC	2	8	7240	7247	0 %	25 %	50 %	25 %	347533708
102	NC_015979	TAC	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533708
103	NC_015979	GGAC	2	8	7368	7375	25 %	0 %	50 %	25 %	347533708
104	NC_015979	CTAGC	2	10	7481	7490	20 %	20 %	20 %	40 %	347533708
105	NC_015979	TAT	2	6	7728	7733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533709
106	NC_015979	ACA	2	6	7766	7771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533709
107	NC_015979	TTG	2	6	7787	7792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533709
108	NC_015979	TAT	2	6	7899	7904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533709
109	NC_015979	TGC	2	6	7908	7913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533709
110	NC_015979	AAC	2	6	7946	7951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533709
111	NC_015979	TTC	2	6	7954	7959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533709
112	NC_015979	TAATT	2	10	8118	8127	40 %	60 %	0 %	0 %	347533709
113	NC_015979	T	6	6	8201	8206	0 %	100 %	0 %	0 %	347533709
114	NC_015979	TTGGGT	2	12	8232	8243	0 %	50 %	50 %	0 %	347533709
115	NC_015979	GTTA	2	8	8287	8294	25 %	50 %	25 %	0 %	347533709
116	NC_015979	TTC	2	6	8302	8307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533709
117	NC_015979	GTAT	2	8	8324	8331	25 %	50 %	25 %	0 %	347533709
118	NC_015979	AAG	2	6	8342	8347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533709
119	NC_015979	AAT	2	6	8366	8371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533709
120	NC_015979	TAG	2	6	8528	8533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533710
121	NC_015979	AT	3	6	8553	8558	50 %	50 %	0 %	0 %	347533710
122	NC_015979	AAAAT	2	10	8597	8606	80 %	20 %	0 %	0 %	347533710
123	NC_015979	AAGA	2	8	8626	8633	75 %	0 %	25 %	0 %	347533710
124	NC_015979	A	7	7	8644	8650	100 %	0 %	0 %	0 %	347533710
125	NC_015979	CCAA	2	8	8696	8703	50 %	0 %	0 %	50 %	347533710
126	NC_015979	AT	3	6	8741	8746	50 %	50 %	0 %	0 %	347533710
127	NC_015979	AAT	2	6	9177	9182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533711
128	NC_015979	ATT	2	6	9204	9209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533711
129	NC_015979	ATT	2	6	9228	9233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533711
130	NC_015979	ATT	2	6	9431	9436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533712
131	NC_015979	ATG	2	6	9450	9455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533712
132	NC_015979	GC	3	6	9550	9555	0 %	0 %	50 %	50 %	347533713
133	NC_015979	CGT	2	6	9623	9628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533713
134	NC_015979	TCG	2	6	9727	9732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533713
135	NC_015979	CAC	2	6	9740	9745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533713
136	NC_015979	TCT	2	6	9808	9813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533713
137	NC_015979	TGG	2	6	9830	9835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533713
138	NC_015979	TCC	2	6	9847	9852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347533713
139	NC_015979	GAT	2	6	9901	9906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533714
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141	NC_015979	TTAA	2	8	10004	10011	50 %	50 %	0 %	0 %	347533714
142	NC_015979	CT	3	6	10021	10026	0 %	50 %	0 %	50 %	347533714
143	NC_015979	ACTG	2	8	10081	10088	25 %	25 %	25 %	25 %	347533714
144	NC_015979	GT	3	6	10203	10208	0 %	50 %	50 %	0 %	347533714
145	NC_015979	CAT	2	6	10319	10324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533715
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151	NC_015979	ATT	2	6	11163	11168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533716
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153	NC_015979	GAT	2	6	11239	11244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533716
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251	NC_015979	AATT	2	8	18856	18863	50 %	50 %	0 %	0 %	347533722
252	NC_015979	TGA	2	6	18886	18891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533722
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257	NC_015979	GATC	2	8	19019	19026	25 %	25 %	25 %	25 %	347533722
258	NC_015979	TTAG	2	8	19052	19059	25 %	50 %	25 %	0 %	347533722
259	NC_015979	GAT	2	6	19079	19084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533722
260	NC_015979	TAT	2	6	19174	19179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533722
261	NC_015979	TGG	2	6	19180	19185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533722
262	NC_015979	ATT	2	6	19245	19250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533722
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